Доктор Вероника Эспиноза, 2023 г. / Twitter @Verukita1
Плагин Network Splitter 3D для Gephi
Z-слои Network Splitter 3D представляют собой определяемые пользователем кластеры и могут использоваться в процедурах ранжирования и/или разделения Gephi [1]. Вы также можете использовать этот плагин для поворота графика по оси X [2,3]. Эту компоновку можно использовать для разделения сетевой компоновки на отдельные Z-слои (Z-слои Network Splitter 3D представляют собой определяемые пользователем кластеры). Например. после использования таких раскладок, как: Yifan Hu, Fruchterman Reingold, Force Atlas, Circular, Layered, OpenOrd и др. [2, 3].
На следующем рисунке показаны основные функции подключаемого модуля Network Splitter 3D.
Что мы узнаем из этого руководства?
В этом руководстве мы узнаем, как использовать плагин Network Splitter 3D,функция которого отображает узлы в разных слоях.
Первое, что нам нужно сделать, это скачать плагин по этой ссылке.
После установки вы найдете этот плагин в разделе макета инструмента Gephi.
Вы увидите следующие параметры, с помощью которых вы можете внести соответствующие корректировки. Каждый параметр объясняется ниже.
Инструкции по использованию подключаемого модуля Network Splitter 3D.
ЧАСТЬ 1. Создайте свою сеть, как обычно.
Шаг 1.Загрузите любой файл по вашему выбору в инструмент Gephi и работайте с сетью, как обычно.
Для этого примера я загрузил подготовленный файл с данными с веб-сайта Pubmed. Для этого файлая применил следующие параметры:Средняя степень и диаметр сети метрики› Разбиение по классу модульности › Ранжирование узлов по степеням › Компоновка кругового пакета.
Для вашей сети вы можете применить нужные вам параметры, например, вы можете ранжировать узлы по другим атрибутам, применять другие макеты, другие цвета и т. д. Также вы можете применять различные показатели.
Когда ваша сеть будет готова в качестве параметров по вашему выбору, вы продолжите применять подключаемый модуль Network Splitter 3D для отображения ваших узлов в разных слоях.
ЧАСТЬ 2. Примените параметры подключаемого модуля Network Splitter 3D к своей сети.
Шаг 2.Когда вы будете довольны своей сетью (шаг 1), вы перейдете к применению соответствующих параметров для подключаемого модуля Network Splitter 3D,, как описано в следующих шагах.
Перейдите в раздел Лаборатория данных› Нажмите Дублировать столбец.
Шаг 3.После того, как вы нажали Дублировать столбец (предыдущий шаг), вы увидите список столбцов, выберите тот, с которым вы хотите отображать свои узлы в разных слоях. В этом случае я выберу столбец «степень», но вы можете выбрать любой столбец, который вам нужен, в соответствии с вашими потребностями в визуализации.
Шаг 4.После нажатия на столбец Степень (или выбранный вами столбец) появится следующее окно, в котором вы должны написать «[z]», как показано на изображении. Затем нажмите ОК (вы увидите, как создается копия столбца в лаборатории данных).
Шаг 5.Теперь перейдите в раздел макет инструмента Gephi и выберите плагин Network Splitter 3D. Вы сможете настроить параметры в соответствии с вашими потребностями визуализации. Просмотрите объяснение каждого параметра на рисунке 1.
В этом примере я скорректировал значения, подчеркнутые желтым цветом, как показано на изображении слева: Z Maximun Level =2 , Z-Distance Factor=2, и я получил сеть, показанная на изображении справа.
ЗначениеZ-Maximun Level — это параметр, который позволитотображать узлы в разных слояхв соответствии с вашим столбцом. выбрано. В этом примере узлы отображаются на разных слоях в соответствии со столбцом «степень».
Вы можете изучить параметры этого плагина и настроить их, пока не будете довольны результатом.
Например, вы можете настроить Z-Maximun Level на 2, 3 и т. д. в зависимости от того, какие слои вы хотите отобразить. Измените значение Коэффициент Z-расстояния, чтобы отрегулировать расстояние между каждым макетом Z-уровня. Настройте вертикальную шкалу Z с помощью параметра Масштаб Z. Настройте альфа-значение, если хотите поверните угол вашей сети.
Наконец, если вы работали с этим плагином, но вас не устраивают результаты и вы хотите начать заново, не волнуйтесь, вы используете кнопку RESET для настройки исходной сети (рис. 7). ).
ЗАКЛЮЧИТЕЛЬНЫЕ КОММЕНТАРИИ
В этом уроке мы рассмотрели, как использовать плагин Network Splitter 3D, который позволяет нам отображать узлы на разных слоях в зависимости от того, какой столбец мы выбрали.
Мы можем использовать этот подключаемый модуль со всеми видами данных, например, мы можем использовать его с данными из Twitter, Wikipedia, Spotify, Pubmed, Tumblr и т. д.. Я использовал его с данными Spotify, где я отображал узлы в разных слоях по популярности илиr по подписчикам . Я также использовал его с данными из Twitter, где я отображал узлы в разных слоях по степени, между центральностью или какую-то другую интересующую колонку.
Как видите, с помощью этого плагина мы можем создавать удивительные визуализации, которые помогут нам представить наши результаты в интересной и привлекательной форме.
Наслаждайся этим!
Примеры сетей, которые я создал с помощью плагинаNetwork Splitter 3D.
(Доктор Вероника Эспиноза)
а) Led Zeppelin Artist Network на Spotify
(Макет двойного круга + Сетевой разделитель 3D)
б) Led Zeppelin Artist Network на Spotify
(Раскладка с радиальной осью + Сетевой разделитель 3D)
в) Led Zeppelin Artist Network на Spotify
(-Force Atlas+ Сетевой разделитель 3D)
г) сеть «Статья-Статья» в Википедии.
(Изометрия + Сетевой разделитель 3D)
e) сеть «Статья-Статья» в Википедии.
(Фрухтерман Рейнольдс + Network Splitter 3D)
f) Сеть опубликованных тем.
(Двойной круг + Сетевой разделитель 3D)
👍Спасибо за чтение.
😃Мой Твиттер
РЕСУРСЫ
🌐 Сетевой разделитель 3D плагин
📥Скачать Gephi здесь
ССЫЛКИ
- Gephi — платформа Open Graph Viz [Интернет]. [цитировано 31 января 2023 г.]. Доступно по адресу: https://gephi.org/
- Сетевой разветвитель 3D [Интернет]. [цитировано 31 января 2023 г.]. Доступно по адресу: https://gephi.org/plugins/#/plugin/network-splitter-3d
- Барао А. Александр Барао | Разработка программного обеспечения: Плагин Gephi — Network Splitter 3D [Интернет]. Александр Барао | Программная инженерия. 2014 [цитировано 31 января 2023 г.]. Доступно по адресу: http://baraoalexandre.blogspot.com/2014/10/gephi-plugin-network-splitter-3d.html
